-
Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
- 积分:1
-
Program on the basis of the object
Program on the basis of the object-oriented programming. Executes drawing of drawings primitives: point, line, rectangle, circle and ellipse.
- 2022-07-02 21:30:35下载
- 积分:1
-
这是一个实现GVF(广义梯度矢量流算法)的matla代码,
这是一个实现GVF(广义梯度矢量流算法)的matla代码,-This is a realization of GVF (generalized gradient vector flow algorithm) matla code,
- 2022-02-01 10:15:46下载
- 积分:1
-
本程序使用vc编程能实现使用生动的调色板淡入淡出位图。只要直接解压便可哦...
本程序使用vc编程能实现使用生动的调色板淡入淡出位图。只要直接解压便可哦-procedures for the use of the program to achieve vc use vivid palette fades out of the bitmap. As can be directly extracted oh
- 2022-01-22 15:54:22下载
- 积分:1
-
利用vc单文档绘制Bezier曲线,单文档学习有效…
利用vc单文档绘制的贝塞尔曲线,是学习单文档gdi绘图的有效参考,同时对贝塞尔曲线的形成原理做了介绍-Vc use a single document drawn Bezier curves, a single document to learn effective gdi drawing reference, at the same time the formation of the principle of Bezier curves introduced
- 2022-05-18 04:14:59下载
- 积分:1
-
这是个基于MATLAB的对图像边缘进行编码的代码,可以直接运行下,不过要自己修改参数...
这是个基于MATLAB的对图像边缘进行编码的代码,可以直接运行下,不过要自己修改参数-This is a MATLAB-based encoding of the image edge of the code can be run directly under, but to modify its own parameters
- 2023-06-19 08:20:02下载
- 积分:1
-
C++ Box2D 源代码
c++Box 2d 源代码 和 相关样例!包含很多个使用Box2D的例子程序!可以进行作为2D有些开发的物理引擎!c + + Box 2d source code and related sample! Contains a number of examples using Box2D program! Some can be developed as a 2D physics engine!
- 2023-06-12 04:30:28下载
- 积分:1
-
tc3.0 prepared with a drawing program, leaves for graphics, dynamic display
用tc3.0编写的一个画图程序,图形为叶子,动态显示-tc3.0 prepared with a drawing program, leaves for graphics, dynamic display
- 2022-08-07 16:06:21下载
- 积分:1
-
Ellipsoid collision detection. Human
椭球体的碰撞检测。在以人形为主的场景内椭球体的碰撞精度比球体、AABB、OBB都要高,同时速度也很快-Ellipsoid collision detection. Human-oriented in the scene of the collision within the ellipsoid accuracy than the sphere, AABB, OBB higher speed quickly at the same time
- 2022-05-30 11:20:35下载
- 积分:1
-
for electronic engineering teaching, the original software Address : http://peop...
用于电子工程专业教学用,软件原地址: http://people.msoe.edu/~saadat/matlabgui.htm-for electronic engineering teaching, the original software Address : http://people.msoe.edu/ ~ Saadat/matlabgui.htm
- 2022-02-02 05:12:21下载
- 积分:1