1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。-IMDN开发者社群-imdn.cn"> 1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。 - IMDN开发者社群-imdn.cn">
登录
首页 » 图形图像 » Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图

Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图

于 2022-02-10 发布 文件大小:6.56 kB
0 72
下载积分: 2 下载次数: 1

代码说明:

应用背景 NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS             join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功! 关键技术 计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。

下载说明:请别用迅雷下载,失败请重下,重下不扣分!

发表评论


0 个回复

  • 696518资源总数
  • 104380会员总数
  • 19今日下载