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从NCBI上自动下载超大序列
应用背景Windows系统,安装了perl环境。可以根据您的搜索条件或者提供的GI号,从NCBI上自动下载超大序列。能自动下载超过50000条以上的核酸或蛋白序列。有时候需要根据自己提供的GI号从NCBI上下载需要的基因或蛋白序列,这个小程序可实现自动下载。在windows操作系统下即可轻松完成,直接双击程序,自动运行下载序列。关键技术放在任何文件夹双击运行。相当于在NCBI首页上查询某物种的基因或蛋白序列,然后自动下载保存为fasta格式。根据使用目的修改脚本。使用方法如下:查询核酸序列:NCBI--左上选Nucleotide--右边输入要查询的物种和限制条件,比如番茄tomato mRNA,出来很多序列,在右下方Search details处,可看到查询条件其实是 ("Solanum lycopersicum"[Organism] OR tomato[All Fields]) AND mRNA[All Fields],复制这个查询条件,粘贴到脚本的第12行$query = ""Solanum lycopersicum"[orgn]"的单引号里面覆盖"Solanum lycopersicum"[orgn],脚本14行$url = $base . "esearch.fcgi?db=protein&term=$query&usehistory=y";里面的db=后面的protein改成Nucleotide,32行$efetch_url = $base ."efetch.fcgi?db=protein&WebEnv=$web"里面的protein也改成Nucleotide。修改这三处之后即可查询得到fasta格式序列。如果查询蛋白序列,按上述方法得到查询条件粘到$query后面,把后面的库db改成protein。查询其它库依此类推。
- 2022-12-23 12:35:03下载
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JAVA计算器程序设计
JAVA计算器程序设计-JAVA calculator program design
- 2022-12-24 14:55:03下载
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of C# graphical programming
浅析C#中的图形编程-of C# graphical programming
- 2022-02-27 07:39:14下载
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这是一个新的聚类算法设计,是由复旦大学的教授们设计的,值得一读。...
这是一个新的聚类算法设计,是由复旦大学的教授们设计的,值得一读。-This is a new clustering algorithm is designed by professors from Fudan University, the design, it is worth a read.
- 2022-12-27 09:25:04下载
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程序首先定义一个hello的函数调用int 21h mov ah ,09来显示字符串,ds:dx定义字符串位置 来使用一个80×25的界面使整个程序更加美观 游...
程序首先定义一个hello的函数调用int 21h mov ah ,09来显示字符串,ds:dx定义字符串位置 来使用一个80×25的界面使整个程序更加美观 游戏主程序调用BIOS int 10 的9号功能实现对目标文本的颜色和定位,。游戏主程序可以用int 16 mov ah,00从键盘读取输入的字符在调用int 21 mov ah,01 让键盘输入显示在屏幕中 al=输入的字符,用cmp指令对输入的文本和目标文本进行比较,再利用选择语句将错误的输入字符显示为红色,将正确的输入字符显示为绿色。在整个字符串结束后直接退到dos环境-procedures hello first definition of a function call int 21 hours mov ah, 09 to show string, ds : dx definition string position to use a 80 x 25 interface to make the whole process more attractive game int main program called BIOS on the 9th of 10 functions to achieve the goal of text color and positioning. Game int main program can use 16 mov ah, 00 input from the keyboard to read characters in the call int 21 mov ah, 01 for keyboard input the screen were al = input characters using cmp directive of input text and the text more goals and used the wrong choice of words to the imported characters shown as red, to the correct input characters shown as green. The entire string after the end of direct retreated dos environmen
- 2022-04-22 08:58:00下载
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程序员/设计师能用上的 75 份速查表
程序员/设计师能用上的 75 份速查表75 份速查表,由 vikas 收集整理,包括:jQuery、HTML、HTML5、CSS、CSS3、JavaScript、Photoshop 、git、Linux、Java、Perl、PHP、Python、Ruby、Ruby on Rails、Scala、C#、SQLite、C++、C语言、Ubuntu、WordPress、Node.js、Oracle、NMAP、Mac OS X、Haskell、Unicode、PostgreSQL、Lisp、Matlab 等。
- 2022-05-13 05:06:05下载
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数字信号处理实验上机报告!实验3:数字滤波器的作用和实现
数字信号处理实验上机报告!实验3:数字滤波器的作用和实现-digital signal processing experimental report on the plane! Experiment 3 : digital filter function and
- 2023-03-30 08:15:04下载
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这是一个cexam SSD1卡耐基的例子
it is a example of CExam ssd1 icarnegie
- 2022-01-26 17:06:57下载
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骨灰盒规范化果腹
骨灰盒规范化果腹-Standardized casket eat
- 2023-01-21 22:55:04下载
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基于BREW平台的SMS实现,很有用的开发技术。
基于BREW平台的SMS实现,很有用的开发技术。-the SMS base on gao tong plataform .
- 2022-02-13 17:46:57下载
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