-
Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述，其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284)，表示两个外显子，中间一个是内含子位置，有些基因组DNA更复杂，内含子数目可能达到10个以上，看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示，一目了然，容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形，只需要把序列下载下来，输入一个命令自动绘图成功！
关键技术
计算机条件：linux系统，我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单，bioperl下载后解压到一个盘上，形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法，在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl，Bio::Graphics后，可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下，在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png，得到的png图像双击就打开，是基因的结构图！！！注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
- 积分：1
-
一个基本的图像特效源码，包括图像不同加载方式、不同…
一个基本的图像特效源码，包括图像不同加载方式、不同叠加方式等动画效果！适合初学者！-A basic source image effects, including images of different loading methods, different ways of stacking animation effects! Suitable for beginners!
- 2022-05-26 04:49:33下载
- 积分：1
-
graphic image processing
图形图象的处理程序-graphic image processing
- 2022-06-18 06:38:05下载
- 积分：1
-
这是一款基于vtk编写的小程序，其主要目的是让大家了如何调用vtk编程，希望对大家有参考意义...
这是一款基于vtk编写的小程序，其主要目的是让大家了如何调用vtk编程，希望对大家有参考意义-This is based on VTK the preparation of a small program, its main purpose is to let everyone how to call VTK programming, in the hope that we have a reference value
- 2022-03-22 08:46:48下载
- 积分：1
-
一个人脸检测的代码.用haar算法实现.
一个人脸检测的代码.用haar算法实现.-a face detection code. Haar used algorithm.
- 2022-08-19 07:35:26下载
- 积分：1
-
很好的一个BSPLINE/BEZIER曲线生成器.速度很快。还有几个例子。
很好的一个BSPLINE/BEZIER曲线生成器.速度很快。还有几个例子。- A very good BSPLINE/BEZIER curve production The speed is very
quick. Also some several examples.
- 2022-06-28 23:47:05下载
- 积分：1
-
这是一个灰度均衡的程序
这是一个灰度均衡的程序-This a gray balanced procedures
- 2023-02-28 08:55:04下载
- 积分：1
-
in VC environment, directly read data, and the map and show that the experimenta...
在VC++环境下,直接读取点数据,并显示成图,有实验数据,适合初学者.-in VC environment, directly read data, and the map and show that the experimental data, for beginners.
- 2022-08-23 23:35:31下载
- 积分：1
-
进行异或图形效果处理
进行异或图形效果处理-for differences or graphics processing
- 2022-08-10 17:20:12下载
- 积分：1
-
自己写的形态学的寻找连通域的实现方法。调用了自己写的腐蚀和膨胀函数...
自己写的形态学的寻找连通域的实现方法。调用了自己写的腐蚀和膨胀函数-Morphological write their own search for the realization of methods connected domain. Call to write their own corrosion and expansion function
- 2022-03-18 22:42:43下载
- 积分：1
